Структура управления учреждением, согласно Уставу:
Директор школы — Мухамбетова Альбина Набиевна;
Общее собрание работников школы — председатель Мухамбетова А.Н.;
Управляющий совет школы — председатель Степанова Светлана Анатольевна;
Педагогический совет школы — председатель Мухамбетова А.Н.;
Совет родителей — председатель общешкольного родительского комитета Чапурина Татьяна Александровна;
Совет обучающихся — председатель Кранчева К.А.
В МКОУ «Маячнинская ООШ» создана и функционирует первичная профсоюзная организация сотрудников — председатель ППО Федорова Лариса Александровна.
Положение об Общем собрании работников МКОУ «Маячнинская ООШ»
Положение об Управляющем совете МКОУ «Маячнинская ООШ»
Положение о Педагогическом совете МКОУ «Маячнинская ООШ»
Положение о Совете родителей МКОУ «Маячнинская ООШ»
Положение о Совете обучающихся МКОУ «Маячнинская ООШ»